町名の由来は「別院 玉龍山」という寺院と、それが建立された村であることから。
群馬県の南部にある佐波郡に属する。古墳時代から栄えていたとされ、室町時代には北条氏康・上杉謙信・武田信玄の領有権争いが繰り広げられた。